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About iRSFC

  • iRSFC는 intuitive resting-state functional connectivity의 약자 입니다.

  • 가장 간단한 방법으로 휴자상태 뇌기능 연결성을 분석 할 수 있는 Matlab 기반의 툴박스 입니다.

  • 기능 뇌네트워크를 분석할 수 있는 프로그램들을 이미 많이 있습니다. 하지만, 너무 많은 기능이 들어 있어서 사용하기가 쉽지 않고 기존에 Event-related fMRI (ER-fMRI) 연구를 하시던 분들이 사용하시게에 생소한 부분들이 많이 있습니다. iRSFC는 ER-fMRI 연구를 하셨던 분들이 쉽게 사용할 수 있도록 디자인한 프로그램입니다. 

  • iRSFC toolbox를 구동하기 위해서는 SPM 툴박스를 미리 다운로드 받고 Matlab에서 Set Path를 설정해야 합니다.

Functionality

  • Seed ROI based functional connectivity analysis: seed로 설정한 뇌영역과 다른 모든 뇌영역간의 functional connectivity를 계산해서 zmap으로 저장하는 기능을 수항햅니다. 이후 분석은 SPM의 [Specify 2nd-level] 메뉴를 통해서 진행하면 됩니다.

  • Network analysis among ROIs: 연구자가 설정한 ROI 영역들간의 기능 연결성을 모두 계산해서 결과를 Comma Separated Values 의 형태로 저장하는 기능을 수행합니다. 이후에 분석은 SPSS 등으로 수행 가능합니다.

Download

  • 아래의 링크에서 간단한 설문에 응답해 주시면 다운로드 링크를 보실 수 있습니다.

  • 어떤 연구자들이 주로 프로그램을 사용하는지 알기 위한 설문이지, 최대한 성의것 응답해 주시면 추후에 프로그램을 업데이트 하는데 큰 도움이 될것 같습니다.

  • 깃허브Github 다운로드 링크: https://github.com/skyeong/iRSFC

Hands-on Exercise

  • 아래의 링크에 있는 메뉴얼을 다운로드 받아서 따라해 보세요^^

  • 다운로드 링크: slideshare

iRSFC Workshop Info

  1.  Sunghyon Kyeong, 'Hands-on workshop on intuitive Resting-State Functional Connectivity (iRSFC)', Department of Psychiatry, Chonbuk National University Hospital, 9 January, 2015. 
    (1) theoretical background on fMRI BOLD signal (40 min.) 
    (2) Hands-on exercise for fMRI preprocessing (60 min.) 
    (3) Hands-on exercise for iRSFC toolbox (90 min.) 
    (4) Multiple comparison issues and AlphaSim correction (20 min.)





댓글
  • 프로필사진 jmi 기대됩니다. *^^* 2015.01.01 19:34 신고
  • 프로필사진 misun 오 진짜 필요한 기능만 딱 모여있어서 좋네요!
    ㅋㅋㅋ 짱짱 잘만들었어요
    2015.01.28 13:04 신고
  • 프로필사진 경성현 이것보다 더 고급기능을 원하는 사람들은 직접 공부해서 구현해야 한다고 생각해. ㅋㅋ 아니면 잘 하는 사람이랑 같이 공동 연구를 하던가. 2015.01.28 14:50 신고
  • 프로필사진 sh kim 이제 처음으로 fmri를 시작할려는 초보입니다.
    이 프로그램으로 run 을 했는데 matlab에서 인덱스가 행렬의 차원을 초과합니다.라는 에러 메세지가 뜹니다. 무엇이 문제인지 답답해서 질문에 올립니다.
    2015.01.30 07:38 신고
  • 프로필사진 경성현 문의하신 내용만으로는 정확히 파악하기는 어렵지만, 입력하신 엑셀 파일의 형식은 잘 맞추셨는지요? 2015.01.30 15:20 신고
  • 프로필사진 sh kim 답변 감사합니다. 엑셀 파일 형식이 문제였었습니다.

    nii 파일을 사용하는데 3D형태나 4D 형태나 둘다 가능한가요?
    2015.01.31 08:19 신고
  • 프로필사진 경성현 네, 상관 없이 작동합니다. 제가 블로그 덧글은 확인을 자주 안해서요~ 이메일로 문의사항 부탁드립니다. 2015.01.31 09:30 신고
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